ക്ഷേത്രം നിലകൊള്ളുന്ന ഈ ഗ്രാമത്തില് പുരാതന കാലത്ത് ജനവാസം തീരെ കുറവായിരുന്നു. ഒരിക്കല് ദേശാന്തിരയായി ചുറ്റിത്തിരഞ്ഞ ഒരു നന്പൂതിരി യുവാവ് തന്റെ യാത്രയ്ക്കിടെ ഈ ഗ്രാമത്തിലെത്തിച്ചേര്ന്നു. തച്ചുശാസ്ത്രത്തില് അതി നിപുണനായിരുന്ന കോയിപ്പുറത്ത് നന്പീശനാശാരിയും നന്പൂതിരിയുവാവുമായി കണ്ടുമുട്ടാന് ഇടയായി. ഈഗ്രാമത്തില് ഒരു ക്ഷേത്രം നിര്മ്മിക്കുന്നതിനെ ക്കുറിച്ച് അവര് സംസാരിച്ചു. ആശാരി നിര്മ്മിച്ച ആരൂഢത്തില് ഭദ്രകാളി പ്രതിഷ്ഠ നിര്വഹിച്ച് നന്പൂതിരി ശാന്തിക്കാരനായി അവിടെ കഴിഞ്ഞു. തുടര്ന്ന് ക്ഷേത്ര ശ്രീകോവില്, മണ്ഡപം, ചുറ്റന്പലം, ബലിക്കല്പ്പുര തുടങ്ങിയവ നിര്മ്മിച്ചു. ക്ഷേത്രം പ്രശസ്തമായതോടെ ധാരാളം ഭക്തജനങ്ങള് എത്തിച്ചേരാനും തുടങ്ങി. തെക്കുംഭാഗത്ത് വളയാപ്പള്ളില് കുടുംബവക സ്ഥലത്തായിരുന്നു ക്ഷേത്രം നിര്മ്മിക്കപ്പെട്ടത്. ക്ഷേത്രനിര്മ്മാണത്തിന് മേല്നോട്ടം വഹിച്ചത് മഞ്ഞിപ്പുഴ തന്പുരാനായിരുന്നെന്ന് ചില രേഖകളില് കാണുന്നുണ്ട്.
കൊല്ല വര്ഷം 1121ല് (1946ല് ) ക്ഷേത്രം തിരുവിതാംകൂര് സര്ക്കാര് ഏറ്റെടുക്കുകയുണ്ടായി.
